2022年12月09日，聊城大学噬菌体研究中心在《Poultry Science》（中科院二区，IF= 4.014）杂志发表了题为“Antibiotic resistance of Riemerella anatipestifer and comparative analysis of antibiotic-resistance gene detection methods”的研究论文。该论文对50株鸭疫里默氏杆菌的耐药表型以及耐药基因的不同数据库检测结果进行了分析与比较，发现其耐药性严重且携带多个耐药基因，不同数据库的检测结果存在差异但总体一致，研究旨在为鸭疫里默氏杆菌的耐药性监测和耐药机理研究提供新的思路与方法。

　　鸭疫里默氏杆菌（RA）是一种危害鸭、鹅等水禽的重要病原菌，RA感染可导致雏鸭死亡，耐过的鸭生长性能下降，为养殖业造成巨大的经济损失。鸭疫里默氏杆菌对抗生素的耐药性逐年上升，抗生素耐药基因（ARGs）是控制耐药性的主要内在因素，目前对ARGs的类型和检测的方法较多，但不同检测方法的结果存在差异，增加了鸭疫里默氏菌临床防治的难度。

　　本研究从不同省份的病死鸭脑组织中分离得到鸭疫里默氏杆菌50株，对其进行了耐药表型测定和全基因组测序，使用Abricate软件的NCBI数据库、CARD数据库、RESfinder数据库对全基因组中的耐药基因进行比对，同时设计PCR引物对流行耐药基因进行检测。对耐药表型、不同数据库耐药基因分析结果、PCR耐药基因检测结果进行比较分析，发现鸭疫里默氏杆菌多重耐药严重，不同数据库的耐药基因分析结果存在一定差异，在线数据库由于其数据库更新及时等原因可检测到更多种类的耐药基因，但总体变化不大。本文也提出了一种新的耐药基因检测方法，即先下载公共数据库中近年来上传的某种菌的基因组信息，使用在线数据库进行耐药基因分析，调查目前该菌的流行耐药基因，针对这些流行耐药基因开展检测与追踪耐药基因的携带与传播情况。

　50株鸭疫里默氏杆菌耐药性统计

　　　　50株鸭疫里默氏杆菌耐药基因分布热图

　　a: NCBI database; b: CARD database; c: ResFinder database; d: CARD online website database

　　聊城大学为论文的第一完成单位，李玉保教授为通讯作者，硕士研究生祝希辉为第一作者，噬菌体研究中心其他老师和硕士研究生参与了该项研究工作。该研究得到了山东省重点研发项目、山东省自然科学基金、聊城大学畜牧学学科开放项目等项目的资助。

　　论文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S003257912200699X?via=ihub#ack0001

（文：祝希辉    审核：李玉保）