2023年10月31日，聊城大学噬菌体研究中心硕士研究生王志伟在《Aquaculture》（中科院一区Top，IF=4.5）杂志发表了题为“Genomic characterization and comparative genomic analysis of pathogenic Vibrio isolated from aquaculture-grown white-leg shrimp (Penaeus vannamei) in Guangdong and Jiangsu, China”的研究论文。

副溶血性弧菌、藻溶弧菌和欧文弧菌严重阻碍水产养殖业的快速发展。本研究旨在分析与南美白对虾肝胰腺坏死相关的致病弧菌菌株的基因组学，包括2019-2022年广东省和江苏省的33株弧菌基因组特征、毒力基因分析、耐药基因鉴定、耐药表型、CRISPR和噬菌体预测、MLST分型和泛基因组分析。

弧菌基因组大小为 4.9-5.9 Mbp，GC含量为 44.4-45.4%，每个基因组都携带超过120个毒力基因，共发现有 20 种耐药基因，有13株（39%）为多重耐药性细菌，至少有14 株弧菌对磺胺甲噁唑、红霉素和阿莫西林表现耐药性，未发现耐药基因和耐药表型的相关性。

图1 耐药基因和耐药表型分析

弧菌菌株均携带不同数量的原噬菌体和CRISPR序列，其中两个原噬菌体携带毒力基因，但不携带耐药基因。共发现17 种不同ST型，主要为ST415。副溶血弧菌具有开放型泛基因组，核心基因组进化树的分辨率要高于MLST进化树。这些数据加深了我们对中国东南方区域弧菌菌株的分子特征和流行病学风险的了解，尤其对对虾养殖业健康发展具有重要意义。图2 泛基因组分析

聊城大学为论文的第一完成单位，李玉保教授和陈端端博士为本文的通讯作者，硕士研究生王志伟为第一作者。该研究得到了山东省重点研发项目、聊城大学博士启动基金、山东省重点研发计划泰山产业领军人才等项目的资助。

论文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0044848623010761?dgcid=coauthor

（文：王志伟 审核：李玉保）