2025年10月24日,聊城大学噬菌体研究中心研究团队在国际抗菌剂期刊《International Journal of Antimicrobial Agents》(中科院二区,IF=4.6)上发表了题为“Global genomic epidemiology of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae, 1996–2023”的研究论文。本研究分析了碳青霉烯酶在全球的流行情况,主要的ST分型以及抗生素耐药基因和毒力基因的分布。这项工作提供了关于耐碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌(CRKP)最全面的基因组流行病学概况。它为加强全球监测建立了基础框架,为制定有针对性的感染控制政策提供了证据,并支持开发基于证据的临床和公共卫生干预措施。
耐碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌分离株分布在101个国家,其中中国(25.11%)、美国(21.63%)和英国为主要国家,耐碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌分离株数量在2018年达到峰值,随后呈下降趋势。
图1 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌分离株的全球分布
我们的分析显示,CRKP中的碳青霉烯酶主要类型为KPC(53.93%),其次为NDM(25.58%)和OXA-48(21.86%)。这些分离株被分为1,046种已知序列型(ST),其中最常见的类型为ST11(23.90%)、ST258(12.85%)、ST147(7.64%)、ST15(5.21%)和ST307(4.03%)。
图2 五种碳青霉烯酶及MLST分型

图3 耐碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌的全球ST及时间趋势
所有CRKP分离株均携带多种抗生素耐药基因(ARGs),其中美国分离株携带的独特ARGs数量最多。主坐标分析显示,中国CRKP分离株的ARGs组成与其他国家分离株存在显著差异。此外,来自中国的耐碳青霉烯酶分离株携带的毒力因子数量最多,与其他地区相比具有显著差异。
图4 耐药基因在国家及主要ST分型的分布情况

图5 毒力基因在国家及主要ST分型的分布情况
结语:本研究对来自101个国家的35,471株耐碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌进行了全面的基因组分析,阐明了这种高度优先病原体的全球分布、时间动态和关键分子特征。这些发现凸显了持续、协调的全球基因组监测对于追踪耐药决定因素和毒力因子的演变和传播至关重要。此类工作对于制定基于证据的感染控制政策和指导针对耐碳青霉烯酶肺炎克雷伯菌分离株的有效公共卫生干预措施至关重要。
作者及项目支持:
本研究由聊城大学噬菌体研究中心仕玉霞、汝东晓、王民歌、曹胜亮、陈端端、司振书、张宇熙、李玉保、路建彪等研究人员共同完成。该工作得到了国家自然科学基金(项目编号:32202859)、山东省高等学校青年创新团队发展计划(项目编号:2024KJI019)、山东省自然科学基金(项目编号:ZR2022MC107)以及国家自然科学基金(项目编号:32372957)的资助。
论文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0924857925002122?via=ihub
(文:仕玉霞 路建彪 审核:李玉保)